1.标的差异：暂比沪通100只股，整体包含沪通标的股。比沪通增加：深交所A+H股和市值50亿以上的恒生综合型股股。2.结算差异：沪通、深通分开换汇、结算、算、交收、申报等；冻结汇率相同，实际换汇不同。3.前端操作：客户前端区分沪通、深通进行分开交易操作：4.不能交叉卖出，但资金可以交叉使用即使有同股，司行为等也须分开独立申报。
(2)．标的区别。
股通是指投资者委托内地证券司，通过上交所设立的证券交易务司,向联交所进行申报，买卖规定范围内的联交所上市的股。也就是说股通是用来让内地的投资者通过上交所来购买香股的业务。沪股通简单来说就是香投资者可以通过香券商的账户买卖上海的部分股，无需到大陆开户。
沪股通：处于香的投资者可通过“沪通”计划下的“沪股通”买卖在上海证券交易所（上交所）的A股。深股通：处于香的投资者可通过“深通”计划下的“深股通”买卖在深圳证券交易所（深交所）的A股。
股通：内地投资者可通过“股通”买卖在香联交所上市的股。简单来说，就是通过相关度和系统安排，实现了内地与香两个资本市场之间的互联互通，内地和香的投资者可以互相买卖在对方交易所上市的股。
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1、开通条件不同沪通开户个与机构需要50万以上的资金，般股账户：无资金限，相对而言比较方便。投资标的开户：沪通266只成分股。般股账户：无投资标的限。2、投资标的股与额度限不同相较沪通，深通下的股通增加了：市值50亿币以上的恒生综合型股指数成份股。同时，九州证券全球经济学邓海表示，的区别在于深市有中板和创业板，深市的成长股是沪通和股市场的补充。
与沪通类比，深通的标的不局限于A/H股同时上市，而将包含深市成分股；由于深市成分股与沪市有很大区别，这将丰富香投资者的投资范围，但的高估值成长股能否得到香投资者认同有很大悬念。
股通是种股，它的范围是香联合交易所恒生综合大型股指数、恒生综合中型股指数的成分股和同时在香联合交易所、上海证券交易所的A+H股司股。沪通包括沪股通和股通两部分：沪通流程图沪股通，是指投资者委托香经纪商，经由香联合交易所设立的证券交易务司，向上海证券交易所进行申报（买卖盘传递），买卖规定范围内的上海证券交易所上市的股；股通，是指投资者委托内地证券司，经由上海证券交易所设立的证券交易务司，向香联合交易所进行申报（买卖盘传递），买卖规定范围内的香联合交易所上市的股。深通，是深股市场交易互联互通机的简称，指深圳证券交易所和香联合交易所有限司建立技术连接，使内地和香投资者可以通过当地证券司或经纪商买卖规定范围内的对方交易所上市的股深通和沪通不同，沪通标的大数是国有企业、蓝筹大盘股。。
