这有可能是对于不同的交易软件来说的。仅对于们通达信的软件来说，没有SH000001这说的，999999确实是上证指数，而所说的000016是上证50的指数而已。上证50指数以2003年12月31日为基日，以该日50只成份股的调整市值为基期，基期指数定为1000点，自2004年1月2日起正式发布。
上证50指数的成份股是在上证180指数的成份股中选取规模大、流动性强的50只股。样本空间：上证180指数样本股。样本数量：50只股。选样标准：规模；流动性。选样方：根据流通市值、成交金额对股进行综合排名，取排名前50位的股组成样本，但市场表现异常并经专委员会认定不宜作为样本的股除外。
上证指数码是000001，但是有些股软件，例如通达信在进行股分析时，为了防止与深圳证券交易所的“平安银行”（股码000001）混淆，也会使用999999作为上证指数码。上海证券综合指数简称“上证指数”或“上证综指”，其样本股是在上海证券交易所上市股，包括A股和B股，反映了上海证券交易所上市股价格的变动情况，自1991年7月15日起正式发布。
1、上市地点不同在深圳上市的股的指数叫深指；在上海上市的股称为沪指。2、构成的指数不同上证指数是加权指数，深证指数是成份指数。3、指数码不同深指指数码399001；沪指的指数码为000001。4、个股不同深指的个股是以002打头的股中企业；而沪指个股则是以60开头的股主板。5、表意思不同上证指数表沪市大部分股的走势；深证成指表大部分深市股的走势。
上证综合指数是上海证券交易所于1991年7月15日开始编和布的，以1990年12月19日为基期，基期值为100，以的上市股为样本，以股发行量为权数进行编。上证指数（SH000001）的全称是上海证券交易所股价格综合指数，是由上海证券交易所编的股指数，1990年12月19日正式开始发布。该股指数的样本为所有在上海证券交易所挂牌上市的股，其中新上市的股在挂牌的第二天纳入股指数的计算范围。该股指数的权数为上市司的总股本。
由于国上市司的股有流通股和非流通股之分，其流通量与总股本并不致，所以总股本较大的股对股指数的影响就较大，上证指数常常就成为机构大户造市的工具，使股指数的走势与大部分股的涨跌相背离。上海证券交易所股指数的发布几乎是和股市行情的变化相同步的，它是国股和证券从业员研判股价格变化趋势必不可少的参考依据。
1、码不同：上证指数码为000001，上证个股码以60开头，深证指数码为399001，深证个股码以00开头。2、上市场所不同：上证在上海交易所交易，深证在深圳交易所交易。
3、新股停牌规则不同：沪市新股上市首日涨幅达到规定的限，停牌30分钟，深市新股上市首日盘中涨幅与开盘涨幅之差达到10%时，交易所对其实施临时停牌30分钟。
